Leagues and Clubs of Estonia2006
Meistriliiga (1. League)
- 1. Tallinna Levadia
- 2. Narva Trans
- 3. Tallinna Flora
- 4. TVMK Tallinn
- 5. Tartu Maag
- 6. Tartu Tammeka
- 7. Pärnu Vaprus
- 8. Lasnamäe Ajax
- 9. Viljandi Tulevik
- 10. Valga Warrior
Esiliiga (2. League)
- 1. Tallinna Levadia II
- 2. FC Kuressaare
- 3. Tallinna Kalev
- 4. Tallinna Flora II
- 5. Nõmme Kalju
- 6. TVMK Tallinn II
- 7. Viljandi Tulevik II
- 8. Kohtla-Järve Lootus
- 9. Tallinna Dünamo
- 10. FC Elva
II. liiga ida/põhi (3. League)
- 1. Narva Trans II
- 2. Sillamäe Kalev
- 3. Tallinna Kalev II
- 4. Maardu Levadia-Juunior
- 6. Jõhvi Orbit
- 7. MC Tallinn
- 8. Tallinna JK
II. liiga lõuna/lääs (3. League)
- 1. Tartu Välk 494
- 3. Pärnu Pataljoni
- 4. Nõmme United
- 5. Sõrve JK
- 8. FC Kose
